台湾地区外事部门发布新闻稿表示，在事件中，菲国公务船侵入“专属经济海域”攻击无武装的台湾渔船，这是违法使用武力行为。

　　外事部门表示，菲国公务船粗暴攻击后，“广大兴28号”渔船失去动力在海上漂流，菲国公务船未依国际社会有关救难的规定，迳行驶离，以致台湾渔民中枪伤重死亡，此举明显悖离人道精神。

　　外事部门指出，菲国公务船非法使用武力，代表国家行为，因此菲律宾政府负有国家责任。

　　外事部门说，案发经查明为菲律宾公务船后，菲国当局一再推诿，辩称菲国公务船是执行勤务紧追，并指称是因台湾渔船意欲冲撞，所作出的开枪自卫行为。

　　外事部门表示，相较菲国执法船舶全长30米，总重115.45吨，台湾渔船长仅14.7米，宽3.68米，总吨位为15.15吨，属小型渔船，且毫无武装，显见菲国“自卫”的说法完全不能成立。

　　经台湾岛内检察机关搜证，发现船体弹痕累累，共计有50多处着弹孔，外事部门指出，菲公务船严重违法使用武力，射杀台湾渔民残酷暴行。

　　因此，外事部门说，菲国宣称公务船“非蓄意”射杀台湾渔民的说法罔顾事实，台湾方面完全无法接受。

　　外事部门表示，台湾方面强烈抗议及谴责菲国公务船违法暴行，严正呼吁菲政府拿出诚意，必须正式道歉、赔偿损失、尽速彻查事实严惩凶手等。